关于开展中国碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目的通知
发布时间：2020年11月12日
肠杆菌目细菌是引起医院感染最常见的病原菌之一，对碳青霉烯类抗菌药物耐药的肠杆菌目细菌（Carbapenem-resistant Enterobacterales, CRE）尤其是肺炎克雷伯菌，近年来检出率呈快速上升趋势，其所致感染病死率高，临床治疗上面临着无药可用的威胁。我国临床分离的CRE菌株在耐药机制上有较大差别，其所对应的临床抗感染治疗方案亦有差异，为深入了解我国CRE菌株中碳青霉烯酶基因型别及地域和人群分布特征，为临床抗感染治疗和感染预防控制提供重要参考依据，经国家卫生健康委医政医管局批准（附件1），国家卫生健康委合理用药专家委员会和中国药师协会将在全国细菌耐药监测网部分核心成员单位中，以主动监测的方式开展临床分离CRE菌株的流行病学调查研究，具体通知如下：
一、活动时间
2020年10月-2022年7月
二、活动方案
具体实施方案见附件2。
三、项目专家组
项目专家组名单见附件3。
四、参与机构
项目参与机构名单见附件4。
五、其他事项
（一）项目由国家卫生健康委合理用药专家委员会办公室和全国细菌耐药监测网负责，委托上海市细菌真菌耐药监测中心担任中心实验室各项工作，委托湖北省和四川省细菌耐药监测中心承担分中心实验室各项工作；
（二）全国细菌耐药监测网各省级监测中心应积极配合组织本辖区内相应机构参与本项目调研；
（三）联系人：
国家卫生健康委合理用药专家委员会办公室 张素秋
电话：010-88312256/88312120
邮箱：zhangsuqiu@heliyongyao.org
中心实验室（全国细菌耐药监测网上海市监测中心） 胡付品
电话：021-52888186
邮箱：hufupin@fudan.edu.cn
地址：上海市静安区乌鲁木齐中路12号
分中心实验室（全国细菌耐药监测网湖北省监测中心）孙自镛
电话：027-83663639
邮箱：ziyongsun@hotmail.com
地址:湖北省武汉市解放大道1095号
分中心实验室（全国细菌耐药监测网四川省监测中心）喻 华
电话：028-87394651
邮箱：yvhua2002@163.com
地址：四川省成都市青羊区一环路西二段32号
附件：1、国家卫生健康委医政医管局关于同意开展碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目的批复
2、中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目实施方案
3、中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目专家组名单
4、中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目参与医疗机构名单
国家卫生健康委
合理用药专家委员会办公室
2020年9月29日
附件1：
国家卫生健康委医政医管局关于同意开展碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目的批复
附件2：
中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目实施方案
肠杆菌目细菌是引起医院感染最常见的病原菌，其主要耐药机制包括产生超广谱b-内酰胺酶和碳青霉烯酶。碳青霉烯类抗菌药物包括亚胺培南、美罗培南和厄他培南等，是目前临床上治疗多重耐药肠杆菌目细菌所致重症感染最有效的抗菌药物之一。但随着该类药物在临床上的广泛应用，碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌（ Carbapenem-resistant Enterobacterales, CRE）尤其是肺炎克雷伯菌的检出率呈快速上升趋势。2019年全国细菌耐药监测结果显示，肺炎克雷伯菌中碳青霉烯类抗菌药物耐药菌株的平均检出率达10.9%，部分省市碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的平均检出率超过20%。由于碳青霉烯类耐药菌株往往表现为广泛耐药特征，使临床的抗感染治疗面临无药可用的困境，导致其所致感染的高病死率。产生碳青霉烯酶是肠杆菌目细菌对碳青霉烯类抗菌药物最主要的耐药机制。研究显示，我国临床分离碳青霉烯类耐药菌株在耐药机制上有较大差别，大肠埃希菌和肠杆菌属细菌以产B类金属b-内酰胺酶为主，肺炎克雷伯菌以产A类KPC型碳青霉烯酶为主，而产不同碳青霉烯酶菌株所致感染的抗感染治疗方案亦有所不同。
目前我国尚无覆盖所有省市临床分离CRE菌株中碳青霉烯酶基因型分布特征的大样本流行病学调查研究。因此，为了解CRE菌株中碳青霉烯酶基因型别及其地域和人群分布特征，为后续针对性抗感染治疗方案和感染预防控制措施的制定提供参考依据。本研究计划在全国细菌耐药监测网范围内，以主动监测的方式开展临床分离CRE菌株的耐药机制及其流行病学研究，具体方案如下。
一、参与单位
全国细菌耐药监测网（CARSS）151所核心成员单位，按不同区域划分，包括三级医院、二级医院和儿童专科医院（包括妇幼保健院、妇儿医院）等。
二、纳入菌株
参与本项目的各医疗机构保留2021年1-6月所有临床分离的CRE菌株（同一患者相同部位同一菌株只保留一株，不同部位分离的菌株需要保留），排除筛查目的标本分离的CRE菌株（如肛拭子标本分离株）。所有菌株经实验室常规方法鉴定到种。所有菌株保存于40%甘油肉汤或其他保存物中，置于-40℃或更低温度下保存（建议保存于-70℃），之后按要求将菌株直接运送至相应中心或分中心实验室，相关资料统一采用在线填写方式完成，中心实验室或分中心实验室需采用质谱等方法对所有CRE菌株进行重新鉴定。
三、CRE的定义
CRE定义如下：（1）对亚胺培南（除外摩根摩根菌、变形杆菌属和普罗威登菌属）、美罗培南、厄他培南或多立培南其中任意一种药物耐药者；或（2）经表型或基因型检测技术明确为产碳青霉烯酶的肠杆菌目细菌。
四、药物敏感性试验
参考最新版CLSI文件要求，中心实验室或分中心实验室采用肉汤微量稀释法测定CRE菌株对临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度（MIC），至少包括以下药物：阿米卡星、头孢他啶、美罗培南、黏菌素、替加环素、头孢他啶-阿维巴坦和环丙沙星等。
五、碳青霉烯酶基因、毒力基因、同源性及遗传特征分析
采用分子生物学方法检测CRE菌株中的碳青霉烯酶基因（包括blaKPC、blaNDM、blaIPM、blaVIM和blaOXA-48等）和主要毒力基因（包括magA、rmpA、wabG、uge、kfu和fimH等），并明确基因型别。采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）或多位点序列分型（MLST）对CRE菌株进行同源性分析，选择代表性菌株进行宏基因组测序分析。
六、临床相关信息调查
通过CARSS信息系统在线填写临床简要信息，包括姓名、性别，年龄，病区，标本类型，感染诊断，住院总费用等。
七、项目管理
本项目由全国细菌耐药监测网组织单位国家卫生健康委合理用药专家委员会办公室负责，下设1个中心实验室和2个分中心实验室，中心实验室负责整体方案的设计、技术指导和质量控制，分中心实验室负责按计划完成具体实验任务。CARSS各省级监测中心单位负责组织成员单位收集和保管临床分离的CRE菌株，并定期运送至中心或分中心实验室。
八、项目伦理学
本研究方案由中心实验室提交伦理委员会审批通过后方可进行，各分中心实验室以中心实验室伦理批件进行备案后开展研究工作。
九、预期结果
（一）了解我国临床分离CRE菌株（包括不同人群、不同标本来源、不同菌种等）产生的碳青霉烯酶基因型及药物敏感性特征;
（二）绘制我国不同区域临床分离CRE菌株碳青霉烯酶基因分布图，为针对不同耐药类型菌株的抗感染治疗方案的制定提供参考，为后续制定有效的感染预防措施提供参考依据；
（四）通过本研究项目，培养相关专业人员10-15名。
十、课题设置和成果归属
本研究将按不同菌种设置子课题开展研究，研究成果归国家卫健委合理用药专家委员会，各子课题负责人可作为第一作者或通讯作者，负责相应研究课题的论文撰写，经国家卫生健康委相关部门审核批准后可发表研究论文。
十一、研究期限
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时 间 |
进度安排 |
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2020.10-2020.12 |
方案讨论、启动会，伦理材料申请 |
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2021.01-2021.06 |
各单位菌株收集和保存、菌株信息在线填报 |
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2021.06-2021.07 |
菌株快递至中心实验室 |
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2021.07-2022.04 |
菌株保存、药敏试验等开展实验研究 |
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2022.04-2022.07 |
资料整理和总结 |
十二、项目研究机构设置
全国细菌耐药监测网负责项目的整体协调和管理，各省级监测中心应配合该项工作的进行。项目委托复旦大学附属华山医院抗生素研究所为中心实验室，同时设置2个实验室作为分中心实验室。
中心实验室及分中心实验室设置
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实验室设置 |
省份数 |
所辖省（区、市） |
委托机构 |
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1 |
11 |
北京、天津、浙江、安徽、河北、山东、辽宁、吉林、黑龙江、上海、江苏 |
复旦大学附属华山医院 |
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2 |
10 |
福建、江西、山西、河南、湖北、湖南、陕西、甘肃、青海、内蒙古 |
华中科技大学同济医院 |
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3 |
10 |
广东、广西、海南、重庆、四川、贵州、云南、西藏、新疆、宁夏 |
四川省人民医院 |
附件3：
中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目专家组名单
中国碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌目细菌流行病学调查研究项目参与医疗机构名单
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省份 |
医疗机构名称 |
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北京市 |
首都医科大学附属北京儿童医院 |
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北京市 |
中日友好医院 |
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北京市 |
首都医科大学附属北京朝阳医院 |
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北京市 |
北京大学第一医院 |
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北京市 |
中国医学科学院北京协和医院 |
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北京市 |
北京医院 |
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北京市 |
北京大学第三医院 |
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北京市 |
北京大学人民医院 |
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天津市 |
中国医学科学院血液病医院（血液学研究所） |
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天津市 |
天津市肿瘤医院 |
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天津市 |
天津市第一中心医院 |
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天津市 |
天津医科大学总医院 |
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天津市 |
天津医科大学第二医院 |
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河北省 |
保定市第一中心医院 |
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河北省 |
河北医科大学第二医院 |
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河北省 |
承德医学院附属医院 |
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河北省 |
秦皇岛市第一医院 |
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河北省 |
遵化市人民医院 |
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河北省 |
石家庄市第一医院 |
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河北省 |
河北省儿童医院 |
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山西省 |
运城市中心医院 |
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山西省 |
山西省儿童医院 |
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山西省 |
长治医学院附属和平医院 |
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山西省 |
山西省人民医院 |
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山西省 |
山西大医院 |
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内蒙古自治区 |
内蒙古自治区人民医院 |
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内蒙古自治区 |
赤峰市医院 |
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内蒙古自治区 |
鄂尔多斯市中心医院 |
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内蒙古自治区 |
内蒙古医科大学附属医院 |
|
内蒙古自治区 |
乌海市人民医院 |
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辽宁省 |
大连医科大学附属第二医院 |
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辽宁省 |
中国医科大学附属盛京医院 |
|
辽宁省 |
中国医科大学附属第一医院 |
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辽宁省 |
辽宁省人民医院 |
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吉林省 |
吉林大学中日联谊医院 |
|
吉林省 |
吉林大学第二医院 |
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吉林省 |
吉林大学第一医院 |
|
吉林省 |
白城市中心医院 |
|
吉林省 |
长春市儿童医院 |
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黑龙江省 |
哈尔滨医科大学附属第一医院 |
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黑龙江省 |
哈尔滨医科大学附属第四医院 |
|
黑龙江省 |
齐齐哈尔市第一医院 |
|
黑龙江省 |
大庆油田总医院 |
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黑龙江省 |
哈尔滨市儿童医院 |
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上海市 |
上海交通大学医学院附属新华医院 |
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上海市 |
上海交通大学附属儿童医院 |
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上海市 |
复旦大学附属儿科医院 |
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上海市 |
上海交通大学附属瑞金医院 |
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上海市 |
复旦大学附属华山医院 |
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江苏省 |
江苏省人民医院 |
|
江苏省 |
南京市儿童医院 |
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江苏省 |
徐州医科大学附属医院 |
|
江苏省 |
苏州大学附属第一医院 |
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浙江省 |
浙江大学医学院附属儿童医院 |
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浙江省 |
浙江大学医学院附属第一医院 |
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浙江省 |
温州医学院附属第二医院 |
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浙江省 |
金华市中心医院 |
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安徽省 |
宁国市人民医院 |
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安徽省 |
安徽医科大学第二附属医院 |
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安徽省 |
蚌埠医学院第一附属医院 |
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安徽省 |
安徽医科大学第一附属医院 |
|
安徽省 |
安徽省立医院 |
|
安徽省 |
安徽省儿童医院 |
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福建省 |
福建省立医院 |
|
福建省 |
福建医科大学附属协和医院 |
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福建省 |
福建医科大学附属第一医院 |
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江西省 |
赣州市人民医院 |
|
江西省 |
赣南医学院第一附属医院 |
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江西省 |
南昌大学第一附属医院 |
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江西省 |
南昌大学第二附属医院 |
|
江西省 |
江西省儿童医院 |
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山东省 |
烟台毓璜顶医院 |
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山东省 |
山东省千佛山医院 |
|
山东省 |
山东大学齐鲁医院 |
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山东省 |
山东省立医院 |
|
山东省 |
山东省临沂市沂水中心医院 |
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山东省 |
济宁市第一人民医院 |
|
山东省 |
山东齐鲁大学儿童医院 |
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河南省 |
郑州大学第一附属医院 |
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河南省 |
河南省人民医院 |
|
河南省 |
河南省中医院 |
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河南省 |
许昌市中心医院 |
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河南省 |
濮阳市人民医院 |
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河南省 |
河南省儿童医院 |
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湖北省 |
华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
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湖北省 |
荆门市第一人民医院 |
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湖北省 |
荆州市中心医院 |
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湖北省 |
武汉大学中南医院 |
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湖北省 |
利川市人民医院 |
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湖北省 |
湖北省妇幼保健院 |
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湖南省 |
中南大学湘雅医院 |
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湖南省 |
湖南省湘潭市中心医院 |
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湖南省 |
郴州市第一人民医院 |
|
湖南省 |
南华大学附属第一医院 |
|
湖南省 |
湖南省儿童医院 |
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广东省 |
深圳市儿童医院 |
|
广东省 |
广东省梅州市人民医院 |
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广东省 |
汕头大学医学院第一附属医院 |
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广东省 |
广州医学院第一附属医院 |
|
广东省 |
广州市妇女儿童医疗中心 |
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广东省 |
中山大学附属第一医院 |
|
广东省 |
广东省惠州市中心人民医院 |
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广西壮族自治区 |
广西壮族自治区人民医院 |
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广西壮族自治区 |
广西医科大学第一附属医院 |
|
广西壮族自治区 |
北海市人民医院 |
|
广西壮族自治区 |
柳州市工人医院 |
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广西壮族自治区 |
桂平市人民医院 |
|
广西壮族自治区 |
广西壮族自治区妇幼保健院 |
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海南省 |
海南省人民医院 |
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海南省 |
海口市人民医院 |
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海南省 |
海南省妇幼保健院 |
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重庆市 |
重庆医科大学附属第二医院 |
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重庆市 |
重庆医科大学附属儿童医院 |
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重庆市 |
重庆市垫江县人民医院 |
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重庆市 |
重庆医科大学附属第一医院 |
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四川省 |
成都市妇女儿童中心医院 |
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四川省 |
四川省医学科学院.四川省人民医院 |
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四川省 |
遂宁市中心医院 |
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四川省 |
自贡市第四人民医院 |
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四川省 |
川北医学院附属医院 |
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四川省 |
四川省科学城医院 |
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四川省 |
绵阳市中心医院 |
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贵州省 |
贵州省人民医院 |
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贵州省 |
遵义医学院附属医院 |
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贵州省 |
兴义市人民医院 |
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贵州省 |
遵义市第一人民医院 |
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贵州省 |
黔东南州人民医院 |
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云南省 |
云南省普洱市人民医院 |
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云南省 |
昆明市第一人民医院 |
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云南省 |
昆明医科大学第一附属医院 |
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云南省 |
保山市人民医院 |
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云南省 |
玉溪市人民医院 |
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西藏自治区 |
西藏自治区人民医院 |
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陕西省 |
西安交通大学第一附属医院 |
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陕西省 |
延安大学附属医院 |
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陕西省 |
陕西省人民医院 |
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陕西省 |
西安市儿童医院 |
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甘肃省 |
甘肃省人民医院 |
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甘肃省 |
定西市人民医院 |
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甘肃省 |
甘肃省妇幼保健院 |
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甘肃省 |
兰州大学第二医院 |
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青海省 |
青海大学附属医院 |
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青海省 |
青海红十字医院 |
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宁夏回族自治区 |
宁夏医科大学总医院 |
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宁夏回族自治区 |
宁夏自治区人民医院 |
|
宁夏回族自治区 |
宁夏回族自治区第五人民医院 |
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新疆维吾尔自治区 |
新疆医科大学第一附属医院 |
|
新疆维吾尔自治区 |
伊犁哈萨克自治州友谊医院 |
|
新疆维吾尔自治区 |
乌鲁木齐市第一人民医院 |
|
新疆维吾尔自治区 |
新疆生产建设兵团医院 |
|
新疆维吾尔自治区 |
喀什地区第一人民医院 |